Los Santos de Atenea forman la mayoría de los personajes del santuario, estos son versiones más jóvenes de algunos de los personajes de Saint Seiya, entre ellos los 12 santos de oro principalmente Aioria de Leo, y los santos de plata Marin de Águila, Shaina de Ofiuco y Misty de Lacerta. También existen dos santos originales de la serie: Noesis de Triángulo y Retsu de Lince.
Los Titanes (ティターン神族 Titān Shinzoku) que habían sido vencidos por Zeus, buscan liberar a Cronos que se encuentra encerrado en su Soma en el santuario para volver a dominar el mundo. Siete años antes del Torneo Galáctico, los Santos de Oro se enfrentan con los Titanes, quienes buscan el Megas Drepanon, con el puede despertar a su señor Cronos. Aioria, Santo de Oro de Leo, secundado por los otros Santos de Oro, le harán frente a los Titanes.
Los dioses primordiales de la mitología griega, también llamados Protogonos son las deidades primigenias, que surgen en el momento de la creación, y cuyas formas constituyen la estructura básica del universo. En el Episodio G son quienes tienen los planes ocultos de la lucha de los Titanes contra los Santos de Atenea.
Los Gigantes (ギガス兵神 Gigasu Hyōshin) pelean junto a los Titanes en su lucha contra los Santos de oro siete años antes de la realización del Torneo Galáctico. Después del intento de Japeto de matar a Mu, Aioria y Aldebaran, Cronos decide llamarlos y les ordena que destruyan todo el Santuario así como la estatua de Atenea y recuperen el Megas Drepanon.